防止病毒病的发生是控制该病的最关键措施，应利用一切有利的农业措施防止病毒病的发生。
培育无病毒菌种。主要从无病毒感染的菇床上挑选种菇。预防带毒的孢子感染菇床。接种后最好用地膜或旧报纸覆盖床面，防止带毒的孢子落入床面。对于个别发病的蘑菇，应及时清楚。
严格把好母种关。凡生长异常，特别是菌丝不整齐的母种要剔除；原种、生长种在培养阶段要经常检查，凡菌丝有缺刻或花斑块的要坚决淘汰。
培养料和菇房一定要严格做好消毒工作，并选用健康的培养料和菌种接种;菇房及时防治菇蝇、菇蚊等害虫，避免传播该病;生产结束后及时清理，并消毒生产场地。