冬小麦出苗后，病菌靠分生孢子或子囊孢子借气流传播侵染秋苗，并在秋苗茎叶组织上越冬。冬季温暖、雨雪多或土壤湿度大，有利于病菌越冬。越冬后的病菌先在植株下部叶片之间传播，以后逐渐向中、上部叶片发展，严重时可发展到穗部。该病发生适温15~20°C，低于10°C发病缓慢。
在夏季干燥的情况下，小麦白粉病病菌以子囊壳在病残体上越夏，秋季子囊壳得到充分湿度后，放射出子囊孢子侵染秋苗；在夏季潮湿条件下，病菌以子囊孢子或分生孢子侵染自生麦苗越夏，秋季产生孢子侵染秋苗。
夏季干燥的时候，小麦白粉病菌以子蘘壳得到湿度放射子蘘袍子侵染秋苗，在潮湿条件下以病菌袍子或分生袍子侵染麦苗越夏秋季产生袍子侵染秋苗。
小麦白粉病发病期间在幼苗到抽穗期，主要危害小麦叶片、茎秆以及穗部位。