西瓜炭疽病属于高等真菌，叶片染病出现轮纹斑。属半知菌亚门、黑盘孢目、刺盘孢属真菌。已知的瓜类炭疽病菌有7个生理小种，西瓜炭疽病通常由瓜类炭疽病生理小种1或3引起。于子叶上先呈现褐色圆形病斑，而后幼茎基部变为黑褐色，且缢缩，甚至倒折。瓜类炭疽病菌分生孢子盘生有黑褐色刚毛，长90-120微米，具有2-5个隔膜，初期埋于寄主表皮下，成熟后突破表皮外露。其分生孢子梗无色，单孢呈圆筒状，大小为（20-26）微米×（2.6-3.0）微米。分生孢子无色，单孢为卵圆或长圆形，具有2-3个横膈膜，大小为（14-20）微米×（5-6）微米，多个孢子聚合一起形成粉红色黏孢子团。
