黄萎病的发生与地温和雨量关系密切，发病适宜温度为25-28℃，25℃以下和30℃以上发病缓慢，35℃以上成为隐症。多雨年份或适温高湿条件利于发病。
甜瓜黄萎病适宜的发病温度为25～28℃，高于30℃、低于22℃发病缓慢，高于35℃出现隐症。在6月份，棉苗4、5片真叶时开始发病，田间出现零星病株；现蕾期进入发病适宜阶段，病情迅速发展；在七八月份，花铃期达到高峰。
棉花黄萎病的发病条件是高温高湿，温度超过35度，多雨潮湿利于发病。
如在干燥土壤、持水量在4%条件下，可存活80余天。对环境压力具有抗逆性，黑色素的另一重要作用表现在能防止水解酶对微菌核的水解作用。
适宜发病温度为25～28℃，高于30℃、低于22℃发病缓慢，高于35℃出现隐症。在6月份，棉苗4、5片真叶时开始发病，田间出现零星病株；现蕾期进入发病适宜阶段，病情迅速发展；在七八月份，花铃期达到高峰。在温度适宜范围内，湿度、雨日、雨量是决定该病消长的重要因素。地温高、日照时数多、雨日天数少发病轻，反之则发病重。在田间温度适宜，雨水多且均匀，月降雨量大于100mm，雨日12天左右，相对湿度80%以上发病重。一般蕾期零星发生，花期进入发病高峰期。连作棉田、施用未腐熟的带菌有机肥及缺少磷、钾肥的棉田易发病，大水漫灌常造成病区扩大。
土壤中的病枝叶残留、土壤湿度大、气温高等都可以诱发棉花黄萎病。