当水质不过关，缸内菌群失衡（有害菌占据主导地位）、毒素超标时（主要是氨亚硝酸盐等），这些毒素首先会刺激鱼的表皮粘膜，一旦表皮粘膜遭到破坏，细菌和寄生虫就有机会在破损处附着寄生，这是造成外部疾病的根源；再者，如果缸内氨等毒素超标，鱼呼吸时，这些毒素就会通过鳃进入体内，同血液中的血红蛋白相结合，影响血液的输氧能力，造成血液缺氧。
高温30～35℃时易发病，伤口有利于病菌侵入；旱育秧较水育秧发病重；增施氮肥刺激病害发展。施用未腐熟有机肥发病重。一般籼稻较粳稻发病重。糯稻发病轻。晚播发病重于早稻。
一是土壤温度为30一35℃易发病；二是未经药剂处理的种子易发病；三是施用未腐熟有机肥过晚的秧田；四是品种抗病性较低的易发病。
温30～35℃时易发病，伤口有利于病菌侵入；旱育秧较水育秧发病重；增施氮肥刺激病害发展。施用未腐熟有机肥发病重。一般籼稻较粳稻发病重。糯稻发病轻。晚播发病重于早稻。
土温30～35℃时易发病，伤口有利于病菌侵入；旱育秧较水育秧发病重；增施氮肥刺激病害发展。施用未腐熟有机肥发病重。一般籼稻较粳稻发病重。
土温30～35℃时易发病，伤口有利于病菌侵入；旱育秧较水育秧发病重；增施氮肥刺激病害发展。施用未腐熟有机肥发病重。一般籼稻较粳稻发病重。糯稻发病轻。晚播发病重于早稻。
带菌种子和病稻草是该病发生的初侵染源。脱谷时，由于脱谷机空隙小，转数过快，可增加种子受伤几率，如播种这类受伤种子比未受伤的种子发病重。脱粒时与病种子混收，也会使健种子带菌。土温30～50℃时易发病，伤口有利于病菌侵入；旱育秧较水育秧发病重；增施氮肥刺激病害发展；施用未腐熟有机肥发病重；一般籼稻较粳稻发病重；糯稻发病轻；晚稻发病重于早稻。育苗床灌水不及时，缺水受旱，发生龟裂，易使幼苗根部受伤，或拔苗时由于育苗床上缺水使根部受伤，这类幼苗插秧后发病重。药剂浸种不彻底的病种子比浸种消毒彻底的种子发病重。
水稻恶苗病发病条件：土温30～35℃时易发病，伤口有利于病菌侵入；旱育秧较水育秧发病重；增施氮肥刺激病害发展。施用未腐熟有机肥发病重。一般籼稻较粳稻发病重。糯稻发病轻。晚播发病重于早稻。
发病条件。土温30～35℃时易发病，伤口有利于病菌侵入；旱育秧较水育秧发病重；增施氮肥刺激病害发展。施用未腐熟有机肥发病重。一般籼稻较粳稻发病重。糯稻发病轻。晚播发病重于早稻。