三系指品种间杂种优势利用。二系指亚种间杂种优势的利用，一系指远缘杂种优势利用。
杂交水稻的三系指不育系，保持系和恢复系；两系是指光敏不育系还可作保持系，一系两用，加个恢复系。一系法是指一次杂交，永远保持杂种优势，现只停留在理论上。
三系是指不育系，保持系和恢复系，不育系与保持系杂交还是不育系，用于不育系制种，不育系与恢复系杂交就是生产大田用的杂交稻种子，必须三系配套，才能源源不断保证杂交种子供应，两系是利用光敏不育系，在长日照时不育，与保持系杂交生产大田用种，短日照时恢复育性，繁殖下一代种子。
一系是指不分离的杂交一代种。二系是指光敏型不育系和恢复系。三系是不育系，保持系和恢复系。