选用抗病品种为最基本的防治措施。合理轮作，清除田间残枝病叶。利用杀真菌药剂处理种子处理。
紫斑病防治方法包括：（1）选用抗病品种为最基本的防治措施。（2）合理轮作（3）清除田间残枝病叶。（4）利用杀真菌药剂处理种子处理，例如用拌种双、多菌灵或福美双的种衣剂拌种。（5）在开花结荚初期可喷洒多菌灵、甲基托布津等杀菌剂。
大豆紫斑病是由菊池尾孢引起的、发生在大豆的病害。主要为害豆荚和豆粒，也可侵染叶和茎。茎秆染病形成长条状或梭形红褐色斑，严重的整个茎秆变成黑紫色；豆荚受害形成圆形或不规则形病斑，病斑较大，灰黑色，边缘不明显；豆粒受害，仅在种皮表现出症状，不深入内部。
紫斑病防治方法：（1）选用抗病品种为最基本的防治措施。（2）合理轮作（3）清除田间残枝病叶。（4）利用杀真菌药剂处理种子处理，例如用拌种双、多菌灵或福美双的种衣剂拌种。（5）在开花结荚初期可喷洒多菌灵、甲基托布津等杀菌剂。
加强田间管理，清沟排湿，在大豆开花始期、蕾期、结荚期、嫩荚期各喷1次药剂，可用70%甲基硫菌灵可湿性粉剂1000倍液或1:1:160倍式波尔多液或65%代森锰锌可湿性粉剂500倍液。
选择抗病品种是最基本的防治措施，合理轮作。