棉花病虫害主要有棉蚜、棉盲蝽、棉叶螨、棉蓟马、棉铃虫、地下害虫（蝼蛄、蛴螬、金针虫、地老虎）、苗病（立枯病、猝倒病、炭疽病）、枯萎病、黄萎病、铃病（疫病、炭疽病、红腐病等）。
棉花病虫害的防治要本着“以防为主，综合防治”的植保方针，农业、物理、生物、化学防治相结合，从源头抓起，从根本防治，不要单一依靠化学防治。主要防治措施1、及时清沟排渍，起垄培土，抢抓晴天全田喷施棉花微量元素叶面肥（棉壮王等），旺长苗要及时化学调控。2、加强棉田灯光诱蛾设施的维护，确保灯光诱杀效果。
棉疫病,虫害主要有:棉蚜、绿盲蝽、中黑盲蝽、棉铃虫、红铃虫、红蜘蛛、小地老虎、叶蝉等,。