病菌在病残体上越冬，翌春条件适宜时，病菌借风雨传播，经20-30天潜育发病后又产生分生孢子进行再侵染。高温多雨条件易发病，华南5-10月气候温暖潮湿易发病，北方8-9月发病重。此外，连作、栽植过密及老根留种的花圃发病重。
菊花斑枯病发病规律，病菌以分生孢子器或菌丝体在病叶或植株基部新芽上越冬，次年温、湿度适宜时分生孢子器释放出大量分生孢子，借风雨、昆虫和农事操作传播至新叶引起初侵染。发病后病斑上不断产生分生孢子进行多次再侵染。温度适宜时田间有雨露即可发病；喷浇后叶片湿润过夜或秋雨多，有利于病菌的侵染、繁殖和传播蔓延，直至终花期不断加重为害。连续降雨或在闷热天气时降雨之后，病情会有明显发展。根头老的植株抗病性差；偏施氮肥使植株嫩弱，也有利于发病。