病菌主要以菌丝潜伏在病虫为害枝、干枯枝、干枯果台、病僵果等处越冬。病菌菌丝生长的最适温度为28℃，最高温度40℃，最低温度2℃。由于病菌有潜伏侵染特点，因此其潜育期在不同品种上和不同时期长短有所不同，有时可长达50～60天。在河南郑州地区，最感病的红绞品种其潜育期：5月份为9～11天，6月份6～8天，7月份4～5天，8月份2～3天。
该病的病原菌以菌丝在病果、果台、干枝、僵果及被潜皮蛾为害枝条上越冬。春季产生分生孢子，借风雨、昆虫传播。分生孢子产生芽管直接侵入表皮，也可通过皮孔、伤口侵入果实。侵入后在果面蜡质层等处潜伏，具有潜伏侵染的特点。自苹果落花至8月中下旬，孢子不断侵染幼果。幼果自7月开始发病，每次雨后均有1次发病高峰，烂果脱落。果实生长后期为发病盛期，贮藏期继续发病烂果。一般密植园、低洼粘土地、排水不良或果树生长郁闭的果园发病较重。病菌可在洋槐上越冬，果园周围植有洋槐则病重。