莴笋菌核病在莴苣的苗期和成株期均可发病。主要危害茎用莴苣的茎基部或莴苣叶片的基部。茎染病时,植株近地面茎部先受害,病斑初为褐色水渍状,发展后成软腐状,并在被害部位密生棉絮状白色菌丝体,后期产生黑色菌核。叶片染病时,发病初始产生水浸状斑,扩大后呈褐色,使叶基部、茎部腐烂,叶片萎蔫死亡。叶用莴苣多由靠近地表面的叶柄或下叶边缘开始表现症状,变为淡褐色水浸状,继而整个病叶变讷、软化、腐烂,天气潮湿时长出灰白色棉絮状菌丝体,以后出现黑色鼠粪状菌核。天气干燥时,叶球外叶仍能保持原形,但呈黄褐色,薄纸状,叶球内部已经腐烂,有空隙和菌核。通常莴苣菌核病造成的腐烂无恶臭,但混生细菌性软腐病后,也有恶臭味。