肉牛口炎病和口蹄疫的病因不同。肉牛口炎病是由口腔内的细菌感染引起的疾病，主要病原体包括放线菌、放线放线菌等。而口蹄疫则是由口蹄疫病毒引起的传染病，可以感染多种有蹄动物，包括牛、猪、羊和马等。
肉牛口炎病和口蹄疫在临床表现上也有很大的不同。肉牛口炎病的症状主要表现为口腔黏膜炎症、口臭、牙龈肿胀、厌食等。在进一步发展的情况下，会出现口腔溃疡、脱屑、牙齿松动等。而口蹄疫的症状则主要表现为发热、厌食、乳房炎症、蹄部溃烂、疱疹等。有时，口蹄疫还会引起牛只的呼吸困难、腹泻和流涕等。
此外，肉牛口炎病和口蹄疫在病程上也有所不同。肉牛口炎病通常是急性或亚急性发作，病程较短，一般在几天到两周之间。而口蹄疫的病程则相对较长，潜伏期5-14天，持续感染2-4周。
肉牛口炎病和口蹄疫的预防控制方法也不同。对于肉牛口炎病，主要的预防措施包括合理饲养管理、加强营养支持、定期检查口腔卫生等。而口蹄疫的预防则主要依赖于疫苗接种和严格的动物检疫措施。