有毒，马蹄莲花有毒，内含大量草本钙结晶和生物碱，误食会引起昏眠等中毒症状。该物种为中国植物图谱数据库收录的无毒植物，其毒性为块茎、佛焰苞和肉穗花序有毒。咀嚼一小块块茎可引起舌喉肿痛。皮肤有小心沾到汁液，要及时清洗，以防过敏。
其毒性为块茎、佛焰苞和肉穗，花序有毒。鲜马蹄莲块茎适量捣烂外敷可治疗烫伤。禁忌内服。误食一点点都会引起呕吐，但煮过后可以喂野猪，煮过的叶子可以治轻微头痛，但药用都必须在医生的指导下使用。
马蹄莲虽然对于食用而言有毒，但本身并不释放出带毒的气体，是可以放在家里观赏的，但是建议家里有小孩的还是要谨慎为好。