水杉种子浸种催芽需要用50-60℃的温水浸泡24-48个小时左右，要等到水杉种子的外表皮出现脱落时就差不多达到了预期的催芽效果。对水杉种子进行催芽的方法多种多样，除了浸泡催芽，还可以采取沙藏的方法进行。
水杉种子是一种比较特殊的乔木种子，与其它种子最大的不同是外表形状上的差异，水杉种子呈扁平片状，看起来非常脆弱。收集完种子后要用布袋或其它器皿将水杉种子装起来进行深度储存，也可以直接与沙子混合，沙子比例约为种子的3倍，搅拌均匀后放置在低温的地窖中储存。
提前进行了催芽的水杉种子发芽率高达95%以上，这样的种子种植在光照、水分充足的地区会生长得更加茂盛。注意不能将水杉种植在潮湿或阴凉的地区，因为水杉耐阴凉能力不强。
水杉喜湿润环境但又不耐积水，水的管理很重要。新移栽的水杉应以土壤保持大半墒为宜，不可过干也不可过湿。移栽初期应浇好头三水，此后可每月浇一次透水，雨季适当少浇水或不浇水，秋末浇好封冻水。
水杉主要病虫害有立枯病和干腐病，可用200单位农用链霉素粉剂1000倍液喷洒。虫害有大袋蛾、白线虫危害，可用0.5%阿维菌素乳油1500倍液喷杀。