芹菜是比较耐肥的蔬菜，全生育期都不可缺肥，而好的肥料必须要有较好的土壤作为载体，提高供肥能力。保水性能强、有机质含量高的沙土壤或者黏土壤，均宜于种植芹菜，保水性差的沙质土壤和过于黏重的土壤不宜安排种植。因为芹菜虽然根系较多，但扎根不深，吸收肥水的能力较弱。因此，要想夺取芹菜高产，必须要以增施有机肥料为主，改良土壤结构，不断培肥地力。据高产农户的经验，在播种或者移栽之前20~30天，每亩应施农家积造充分腐熟的土杂肥4000~5000公斤，或商品有机肥150~200公斤，或生物有机复合肥75~100公斤，对于缺硼的大田，应施硼砂1~1.5公斤，或持力硼0.4~0.5公斤。
同时，还应配施磷肥40公斤，钾肥10~15公斤。据农业科研部门研究，每亩产4000~5000公斤芹菜，应施纯氮13~16公斤，五氧化二磷5~6公斤，氧化钾6~9公斤。芹菜定苗后再根据苗情追肥3~4次，当叶柄初现空心现象时，要补施氮肥，当叶柄初现褐色裂纹时，要及时喷施硼肥，可喷施0.2%硼砂或0.1%~0.15%速乐硼。由于芹菜喜欢湿润的环境，无论芹菜保温栽培还是大田种植，都要随即浇水，确保有足够的墒情，如果长期干旱，就会使叶柄过早地纤维化，影响品质。
