再利用栽培鸡腿菇栽培草菇、平菇、香菇、木耳、蘑菇等配种的废料，只要菌丝生长较好，培养料未被杂菌污染，均可将其晒干整碎后添加30%到新原料中栽培鸡腿菇，其效益相当可观。
加工成菌糠饲料食用菌废料中仍有大量的菌丝存在，而菌丝中含有大量的蛋白质和多种氮基酸未被利用。将那些菌丝生长洁白，培养料未被污染的原料及时晒干后粉碎，添加10%左右到饲料中喂猪、鸡等畜禽动物，同样可取得降低养殖成本，提高效益的目的。
用作林果业、农作物、花卉种植的肥料种菇后的各种原料是一种优质的有机菌肥。如在苹果等果园内进行环状抽槽，沟槽深50厘米，把食用菌肥料深施后掩埋，可起到改良果园土壤、提高水果品质、增产增收的效果。而且肥效持久，经济实惠。也可做棉花花蕾肥，红薯、洋芋的基肥，可显着提高产量。在花卉种植中，把食用菌废料与肥土混合后堆积自然发酵，用作花卉苗圃、花盆的养花基肥，对花卉的土壤结构、通气性、保水持水能力大有改善，长出的花草枝繁叶茂，花朵艳丽，且成本极低。
用作灭菌燃料凡属袋栽的菌类品种，如平菇、香菇、木耳、金针菇、银耳、灵芝等，将出菇后的废菌筒晒干收藏，再用来做生产菌种和熟料栽培时的灭菌燃料。
菇棚的加温燃料我国北方，冬春季节自然温度低，塑料大棚若不辅于升温措施很难出菇，可以将升温设施加以改造，燃烧废料来提升塑料大棚内的温度。
