1、选用抗病品种。一般而言，辣椒比甜椒抗病，尖椒比泡椒(长灯笼形、短粗牛角形)抗病。也可以说是叶色浓绿、叶片细长的比叶色浅、叶圆而大的品种抗病;果实长而尖的线椒、羊角椒比牛角椒、灯笼椒抗病。尖椒中，川椒公司选育的抗病一号、干椒一号、干椒二号、晚抗二号、A特早等对病毒病抗性强;泡椒中，川椒B特早、大果B特早、丰优B特早、秋延一号、秋延二号、晚抗一号等，对病毒病抗性强。
2、种子消毒。种子先用清水浸4小时，再放入10%磷酸三钠加200倍的多菌灵药液中浸20分钟消毒，对病毒病等多种病害有预防作用。种子淘洗干净后再播种。
3、遮阳降温。大棚春茬辣椒从6月中旬前后开始、秋延后辣椒从苗期至9月中旬都应覆盖遮阳网，可减弱光照强度，降低温度4-6℃，有利辣椒生长和增强抗病性。大棚四周间作苦瓜等藤果菜，往棚架上爬藤，也可给辣椒遮阳降温。露地栽培的，采用辣椒与玉米、豆角等高秆作物间作，高秆作物能给辣椒遮阳，又可阻碍蚜虫的迁飞，对病毒病有较好的防治效果。
4、及时灭蚜。从辣椒苗期开始经常及时地喷施吡虫啉等药防治蚜虫，切断传毒媒介。
5、管理措施。对辣椒施肥要多施腐熟农家有机肥、控制氮肥，增施磷钾肥;干热天气要保证水肥供应，使辣椒生长健壮。越夏生长的辣椒，于6月下旬在畦面覆盖4-6厘米厚的麦秆、油菜秆或稻草，能降低地温，保水保肥，有利辣椒生长，增强抗病性。栽培秋延辣椒，有条件的可在畦面覆盖黑色、银灰双色地膜，以驱蚜、防病毒病、防草、保湿。
6、药剂防治
⑴30公斤水中加5支医用病毒唑、5克1%芸苔素481(先用55-60℃水溶解)，混匀后喷施，7-10天1次，连续2-3次，病毒病治愈率高。
⑵15公斤水中加病毒KⅡ号水剂25毫升、兽用盐酸吗啉呱2支(20毫升)、细胞分裂素15克。
⑶辣椒病毒展叶灵750倍液，加爱多收6000倍液。
