一、土壤中异物影响：在山药沟中存有石块、砖块、胶泥块等硬物，填沟时未能仔细地剔除或充分粉碎，山药块茎在生长中遇到这些硬物，生长点受阻而改变生长方向，形成分杈、扁头等多种畸形。
二、盲目施用种肥：有些网友在种植山药时，为使出苗后苗壮、生长迅速，而施用各种各样的种肥(开沟后摆放山药栽子前撒入沟内)，但由于种肥施用过多或未能充分与土壤混合，摆放山药栽子时，栽子与种肥接触，把芽或生长点烧坏，造成块茎分杈、多头等畸形产生。
三、山药沟内施用未腐熟的有机肥：山药生育期较长，需要源源不断地供给肥料，保证其正常生长发育。因此，在种植时施用肥效较长的有机肥，如重施厩肥、堆肥、人粪尿、饼肥等，这些有机肥在施入田间之前均应经过充分发酵、腐熟，但有部分菜农为省时省工，未能按照要求在前一年夏季或秋季把有机肥进行充分地发酵腐熟，而是在当年春季把刚刚从养殖场运来的动物粪或未腐熟的人粪尿等直接施入土壤中，这些未腐熟的有机肥施到田间后，必须经过发酵、腐熟这一分解过程，而发酵时产生的热量容易伤害山药根系和块茎，农民俗称“烧根”。特别是块茎尖端，组织细胞柔嫩，是整个块茎的生长点，碰到未腐熟的粪块很容易被烧坏，从而使基端分生组织的汁液外渗，形成分杈或块茎外表麻脸状等畸形。如果山药毛细根被烧坏，影响养分的吸收，则产生蛇形、葫芦状畸形等。
4、地下害虫危害：在山药种植时，沟内没有施用防治地下害虫的药剂，地下害虫在生长过程中对山药块茎生长造成危害，如咬食、截断生长点，使山药块茎不能正常生长，造成畸形。
