作物生长情况以及施肥效果与气象条件有亲密关系。光照影响作物的光合作用，而光合作用的产物—糖，是供给根系呼吸作用的能源，能源不足会影响根系对养分的吸收。所以在光照不足条件下，氮、磷、钾、钙、镁、锰等元素的吸收量显然减少。温度既影响肥料在泥土中的转化，又影响作物根系对养分的吸收。如山区的水稻常用温度低的水灌溉，水稻容易发生稻瘟病，就是因为低温，影响了水稻对硅和钾的吸收所致。水分一方面可加快肥料溶解，增进作物对养分的吸收，另一方面，如水分过多，不仅泥土通气性差，不利作物对养分吸收，而且还会造成养分的散失，所以在雨天不宜施肥，在晴天施肥也要依据泥土干湿情况决定施肥浓度，如土湿，肥料可用得浓一些；如土干，则肥料应稀释后施用。
人们在长期的生产实践中，总结出依据气象情况对作物可能引起的缺素症，进行施肥预报。如早春低温年份，水稻容易发生缺磷、缺锌，应留意磷肥或锌肥的使用；在光照不足条件下，应增施钾肥，可提高作物对光能的利用；在干旱年份，油菜容易涌现缺硼，蔬菜（大白菜、萝卜等）容易产生缺钙，应留意硼肥和钙肥的使用；在多雨季节，容易引起泥土中有效铁的散失，果树常涌现缺铁症。
