一般旧窖要求应彻底打扫干净，窖壁要刮去一层土，以见到新土为度。窖内应进行熏蒸，达到预防病害的目的。熏蒸方法有药剂熏蒸和麦草熏蒸两种方法。药剂熏蒸法：高锰酸钾7公斤置于容器中，按每立方米40%福尔马林10毫升用量，将福尔马林注入，产生消毒气体进行熏蒸；麦草熏蒸法：麦草放入窖内，点燃熏蒸。采用任意一种熏蒸法后应密闭薯窖48小时，然后打开通风口和窖门。
新建窖应选择地势较高、干燥，背风向阳，地下水位低、土质坚实、排水性好的山坡地。
为了提高马铃薯耐贮性和抗病菌能力，减少其原有热和呼吸热，达到安全贮藏的目的，一般要求马铃薯收获后先行预贮。
预贮的环境条件要求温度10-15℃，相对湿度80-90%，预贮时间10-15天。预贮方法是将新收获的薯块置于阴凉且通风良好的场所摊开，上面用草帘遮光。
