随着有机肥的大量推广应用，各种各样的商品有机肥应运而生。商品有机肥有机质分子小，能被蔬菜极容易地吸收，但因缺乏逐步分解的过程，因此对土壤的改良作用则不能与大量农家肥相提并论。
农家肥因价格便宜，可大量使用，如大棚茄子每亩可用鸡粪20-25方，鸭粪30方左右；西红柿每亩施鸡粪13-15方，鸭粪20方左右。农家肥分子大，大部分不易被蔬菜直接吸收，需要在土壤中逐步分解后才能被根系吸收，这个有机肥分解的过程就是改土的过程，从这一层意义上说，我们提倡施用大量的农家有机肥，配以适量的化肥做基肥，既能快速提供蔬菜所需的营养，又能持续供应，而且还能对土壤起到很好的改良作用。
当然，如果您的资金充足，可以施用大量的商品肥来代替大量的农家有机肥，效果也不错。一般蔬菜每亩每年要施用商品有机肥500公斤以上，就能大体满足蔬菜需要，保持土壤疏松的状况，使地越种越肥，达到良性循环。而通常情况下，因其成本太高而难以大量使用，所以菜农还是应以使用农家有机肥为主，辅助以商品有机肥进行生产。
