根据原料的化学性质和来源，一般分为富氮原料和富碳原料两大类。
（1）、富氮原料在农村，这类原料主要指人、畜、禽粪便，这类原料颗粒较细，氮素含量较高，其碳氮比(含碳量与含氮量之比，用C/N表示)一般都小于25：1，因此，不必进行预处理，分解和产气速度较快。
（2）、富碳原料这类原料主要是各种农作物秸秆，其碳素含量较高，其碳氮比一般在30：1以上。农作物秸秆通常是由木质素、纤维素、半纤维素、果胶和蜡质等化合物组成，分解和产气速度较慢。因此，使用这种原料，在入沼气池前，要进行预处理，以提高产气速度。
（3）、其他原料除上述两类主要原料外，农村的一些水生植物如水葫芦、水花生、水草等，由于其繁殖速度快，产量高，组织鲜嫩，能被沼气菌群分解利用。所以，也是沼气发酵的一种好原料。乡镇工业有机废物废水，也含有机物，是沼气发酵的好原料，但由于其来源不同，化学成分、发酵产气潜力等差异较大，因而其发酵工艺不尽相同。
