百香果的种子无休眠期，采收后即可播种，种子繁殖一年四季均可进行，但以春、秋播种为佳。选长势健壮、无病虫害、高产稳产的植株作母株，采果形端正、稍重、完全成熟的果实，取出种子，去除假种皮，洗净后阴干并尽快播种。用水浸发酵3～4天或与粗沙一起放入瓶中摇动、用砂纸擦破种皮的方法可提高种子发芽速度。播时按每亩1.5公斤种子用多苗灵15~30克拌种20分钟左右，以河沙为基质，然后将种子均匀撒播在苗床上，盖一层薄草，淋足水。
百香果种子一般需经20天左右才破壳露芽，萌发适温为24C。气温低于15℃时，需用塑料薄膜覆盖，保温保湿，整个幼苗期保持土壤湿润。播后应根据天气情况淋水，晴天每天早晚各喷一次水，约半个月后开始出土。当出苗达80%以上时应及时追肥，可用稀粪水或0.3%以下稀尿素液泼浇以培育壮苗，幼苗长出2片真叶后用0.1%多菌灵或托布津溶液每隔一周喷一次，连续喷2次。为提高种植成活率和便于运输，幼苗长出1~2片真叶时，可进行装袋栽培，苗木长出4片（净地育苗）~8片（袋装育苗）真叶后可出圃移栽大田。