1.菌种和季节的不适应性。如果在冬季栽培了高温型品种的平菇，会引起平菇的不适症，主要表现为发菌缓慢，出菇迟，甚至不发菌不出菇。因此冬季栽培平菇要选择低温型的品种。同理，在春、秋平菇的生长旺季，就要选择高温型的品种。
2.菇场环境不适致中毒。如选择在阴暗、通风不畅的房间，或选在不卫生的场所种菇，这些都是引起杂菌污染的原因。杂菌分泌的毒素抑制了平菇的生长，出现了中毒症状，表现为平菇不能正常生长，甚至完全报废；有的虽勉强发菌，却又因出菇期二氧化碳含量过高而受害，致使不能出菇或形成畸形菇。因此在选择种菇场所时，应选择通风条件好，并有散射光的干净卫生场所。
3.培养料污染。如果选用了已被污染、结块的原料栽培平菇，或调配营养料时为补充氮源而向料内加入过量的尿素或其他的化肥，会造成大面积污染，导致不发菇或发菇缓慢。所以首先要选择清洁、未结块的培养料；其次要注意，只有在堆料发酵种菇时才加一定量的尿素，而生料栽培不可随意添加尿素或其他氮肥。