1、番茄病毒病：有花叶型、蕨叶型和条斑型，主要症状为卷叶，落蕾落花，果实形成花脸或腐烂。防治方法：选用抗病品种；安排栽培季节，尽可能使幼苗期避开高温多雨时期；用70℃高温处理干种子，用0.1%高锰酸钾溶液消毒；实行3-4年轮作，清洁田园，治蚜防毒；发病初期用30%的病毒A500-700倍液喷雾。
2、番茄叶霉病：为害叶片，使叶面产生椭圆形或不规则形淡黄色褪绿斑，叶背面初生白色霉层，后变为灰褐色或黑褐绒毛状，即分生孢子梗和分生孢子。病情严重时，叶片卷曲，植株干枯，果实不能正常着色，成熟。
防治措施：
1、通过生态调节手段，控制湿度，造成不利病害发生的环境条件。如通风换气等。
2、初期采用50％利霉康800—1000倍液，或60％防霉宝600倍液，或75％百菌清WP600倍液，或10％世高水分散粒剂800—1500倍液喷雾。连阴天气用烟雾剂熏蒸效果较好，可用45％百菌清烟剂250克/亩，熏一夜即可。