1、缺氮
番茄缺氮时，植株瘦弱，叶色淡绿色或黄绿色，叶小而薄，叶脉由黄绿色变为深紫色，茎秆变硬并呈深紫色。花蕾变为黄色，易脱落，果小而少。
2、缺磷
番茄缺磷时，早期叶片背面出现紫红色，脉间先出现一些小斑点，随后扩展到整个叶片，叶脉及叶柄最后变成紫红色。茎细长，富有纤维，叶片小，后期出现卷叶，结实延迟。
3、缺钾
番茄缺钾时，老叶和小叶呈灼烧状，叶缘卷曲，脉间失绿，有些会在失绿区出现边缘为褐色的小枯斑，以后老叶脱落，茎变粗，木质化。根细弱，果实成熟度不一，畸形。
4、缺钙
番茄需钙量大，花期缺钙可发生顶裂果，幼果脐部及周围果皮开裂，胎座组织外翻，使幼果形成七翻八裂的畸形果。幼果膨大期缺钙，可形成脐腐果，俗称“黑膏药病”，发病初期在果脐附近出现黄褐色斑点，随病斑扩展变为褐色，向内凹陷、变硬，果实停止膨大，提早变红，果形变扁，果面少光泽。
5、缺镁
新生叶片卷曲，中下部叶片普遍黄化，并由下往上发展。番茄缺镁时，叶绿素含量低，叶片黄化，光合作用微弱，严重影响营养的积累，可造成大幅度的减产。
6、缺锰
番茄缺锰时，叶片脉间失绿，距主脉较远的地方先发黄，叶脉保持绿色。以后叶片上出现花斑，最后叶片变黄，很多情况下，先在黄斑出现前出现褐色小斑点。严重时，生长受抑制，不开花，不结实。
7、缺硼
幼苗子叶和真叶发紫，叶片僵而脆。茎生长点发黑、干枯，在生长点附近长出新的侧枝。整个植株呈丛生状。顶端的枝条向内卷曲，发黄而死，叶片、叶柄及中脉都变脆。果实成熟期不齐，果实常覆盖一些暗黑色的疤痕，并破裂。
8、缺硫
叶色淡绿色，向上卷曲，植株呈浅绿色或黄绿色，心叶枯死或结果少。