1、死苗
棉苗初放真叶阶段是抗逆力最弱，容易发病死苗的薄弱环节，也是苗病防治的关键时刻。防治措施：（1）加强农业防治，及时扶理春花，疏通三沟，改善棉田基础环境。（2）初放真叶时，用77％可杀得1000倍液，或77％冠菌铜600倍液或0.5％波尔多液进行喷雾防治。
2、蜗牛
防治措施：（1）可采用堆草诱集和人工捕捉相结合。（2）严重地块用6％密达0.5公斤/亩或2％灭旱螺0.4公斤/亩进行诱杀。傍晚施药，撒放于棉苗根际土表。
3、小地老虎
防治措施：（1）由于小地老虎地区间差异较大，可根据防治指标进行防治。移栽苗防治指标为被害株率达2％，直播苗被害株率达5％。（2）用50％辛硫磷1000倍液，或20％杀灭菊酯2500倍液浇根。