（1）床土消毒床土应选用无病新土。如用旧园土，应进行苗床土壤消毒。方法是：每平方米苗床施用50％拌种双粉剂7克，64％杀毒矾或25％甲霜灵可湿性粉剂9克＋70％代森锰锌可湿性粉剂1克对细土4-5千克拌匀，施药前先把苗床底水一次浇透，一般15-20厘米深，水渗下后，取1/3充分拌匀的药土撒在畦面上，播种后再把其余2/3药土覆盖在种子上面，即上覆下垫。将种子夹在药土中间，防效明显。或每平方米苗床用50％多菌灵可湿性粉剂8克处理畦面。
（2）种子消毒防治黄瓜枯萎病用60％多菌灵盐酸盐（防霉宝）超微粉加0.1％平平加浸种60分钟，捞出后冲净催芽。也可把干燥黄瓜种子置于70℃恒温处理72小时，但要注意品种间耐温性能及种子含水量确保发芽率。防治黄瓜细菌性病害，还可用次氯酸钙300倍液，浸种30-60分钟，或40％福尔马林150倍液浸1.5小时或100万单位硫酸链霉毒500倍液侵种2小时，冲洗干净后催芽播种。防治黄瓜疫病可用72.2％霜霉威盐酸盐（普力克）水剂或25％甲霜灵（瑞毒霉）可湿性粉剂800倍液浸种半小时后催芽。
(3)土壤消毒保护地黄瓜定植前用25％甲霜灵可湿性粉剂750倍液喷淋地面。或用50％多菌灵可湿性粉剂每亩4千克，混入细干土，拌匀后施于定植穴内。黄瓜疫病严重的温室大棚，定植前用25％甲霜灵可湿性粉剂750倍液喷淋地面。