1、药剂防治早春在木瓜发芽前，喷1次波美5度的石硫合剂；3-4月份木瓜谢花后至果实采收前，可每隔10-15天，喷1次50%多菌灵500倍或50%甲基托布津800倍液，连喷2-3次，并可兼治叶部病害。
2、防虫伤桃蛀螟是危害木瓜果实的重要害虫，6月中下旬，正当木瓜果实膨大时，雌蛾将卵产于果实梗凹和贴缝空隙处，幼虫孵化后，即咬破果皮蛀入果内。不仅纵横串食果肉，且造成虫伤口，有利于病菌侵入。防治方法：在幼虫孵化期，喷90%晶体敌百虫1000倍液或杀螟松乳剂1500倍液，每7天1次，连喷3次。
3、处理病残体木瓜收获后，结合冬季修剪，剪除病枝，摘除病果，集中烧毁，能有效的减少越冬菌源。