1、轮生枝过多
在基部轮生4~5个枝，造成树体卡脖现象，导致树体中心干细弱，影响树体生长势。
具体修剪操作方法如下：把轮生枝中的1个下部枝疏除，1个重回缩，再把其余2~3个枝压下拉平。
2、定干过高
苹果树定干高度超过120厘米，树干下部光秃，树体长势较弱，成型晚，不利于早期丰产。
具体修剪操作方法如下：在树干上适当的部位进行刻芽，或在适当部位进行腹接。
3、定干过低
苹果树定干高度低于60厘米，树干下部大枝多而壮，但低位新梢长得很长，树体中心干不明显，贴地枝结果质量差，影响树冠的形成。
具体修剪操作方法如下：对树体上部枝进行短截，以增加枝量；对下部大枝进行环剥，结果后逐年疏除，以增强果树上部生长势。
4、修剪过重
由于树体杂乱，整形修剪后，疏除了大部分无用枝条，造成修剪过重，树干上主枝伤痕累累，树势衰弱，领导枝生长也较弱，影响树体生长势。
具体修剪操作方法如下：对树干上的无用大枝，可适当疏除一部分，重回缩一部分，用连三锯法压下一部分；对主枝上的背上枝，无空间的疏除，有空间的可重截拉平。
5、纺锤形树体，拉枝过多
生产中有的果农在纺锤形树体整形中除了疏枝就是拉平，疏除无用枝，其余部分全拉平，造成背上枝丛生，拉平枝延长缓慢，从而影响树冠的扩大，这种方法是不正确的。
具体修剪操作方法如下：树体下部的拉长枝长度为100厘米以上，上部的拉长枝长度为50~60厘米，对各部分枝条，达到拉枝长度的进行拉枝；未达到拉枝长度的在饱满芽处短截，也可任其自由继续延伸。
6、重视冬剪，轻视夏剪
冬剪疏枝截枝较多，修剪量大，进入生长季节后，剪口附近萌芽多，背上枝旺长，拉枝工作跟不上，就会造成冬剪清膛，夏季满膛，冬季又清膛的恶性循环，既浪费树体的大量营养，又延迟结果，果品质量差，影响经济效益。
具体修剪操作方法如下：旺树冬剪时，疏截要适中。对缺枝部位在萌芽前进行刻芽；4月中下旬及时抹除剪口处的无用芽；5月下旬对较旺的辅养枝进行环剥；7~8月份拿枝软化调整角度；秋季对角度小的骨干枝在基部开角，疏除过密的直立枝、徒长枝和竞争枝。