主要发生在保护地栽培的菜豆上。发病时，多从近地面茎基部或第一分枝处开始受害。初为水浸状，逐渐形成灰白色，皮层组织发干萌裂，呈纤维状。气候潮湿时，在茎的病组织中腔部分有黑色菌核。蔓生架豆从地表茎基部发病，可以致整蔓萎蔫死亡。
病菌在病残体上、堆肥中、在种子上以菌核越冬，不产生分生孢子。子囊成熟后，遇到空气湿度的变化即将囊中的孢子射出，随风传播。菌核有时直接产生菌丝。病株上生长的菌丝具较强的侵染力，成为再侵染源而扩大传播。菌丝的发展，使被害部腐烂。菜豆菌核病在比较冷凉潮湿的条件下发生，适温为5-20℃，最适温度为15℃左右。子囊孢子萌发的温度范围很广，在0-30℃均可萌发，而以5-10℃最适宜。菌丝在0-30℃均能生长，但以20℃最适宜。菌核形成的温度与菌丝生长要求的温度一致，但菌核在50℃以下，5min即可死亡。菜豆菌核病菌对湿度要求严格•在潮湿土壤中，能成活3年以上，但菌核不易萌发。菌核萌发要有一定的水分及冷凉潮湿的条件。菌核病菌的接种体及菌丝侵染菜豆时，要求植株表面保持自由水48-72h；被害植株上的菌丝侵染时，需16-24h，但相对湿度低于100%病菌即不能侵染。菜豆菌核病一般在开花后发生，病菌必须在衰老的花上取得营养后才能侵染健康部位。由于蔓生菜豆为无限花序，因此受害期比较长。
防治方法：①从无病株上采种，如种子中混有菌核及病株残屑，播种前用10%盐水选种；②轮作、深耕与土壤处理，收获后进行一次深耕，使大部分菌核埋在6cm土层以下，掌握在于囊盘出土盛期进行中耕，切断子囊盘；③勤松土，除草及时，清除下部老叶、病株；④铺盖地膜，合理施肥，利用地膜阻挡子囊盘出土，要求铺严，避免偏施氮肥•增施磷、钾肥；⑤药剂防治：40%菌核净可湿粉剂1000-1500倍液，或50%甲基托布津可湿性粉剂500倍液，或25%多菌灵可湿性粉剂400-500倍液，一般由发病初期结合清除病残株喷洒农药，重点喷花器与老叶•蔓生菜豆一般10-15天1次，矮生菜豆每周1次。