近年来，辣椒病毒病发生较重，绝大部分地块都不同程度遭受病毒病的损害，几乎成了辣椒减产的主要病害。辣椒一旦受到病毒病严重损害，只长茎叶不长果实，最终导致辣椒减产，甚至绝产。
一、病毒病的品种及鉴别
辣椒病毒病主要有花叶型、畸形、坏死型、条斑型。其中坏死型发病急，蔓延速度快，损害大。叶片上病毒病有三种，果实有一种。其中花叶型，植株项部叶片呈显然黄绿相间魄花叶，有的叶面皱缩，显然的褐绿斑驳，是常见的一种病毒。畸形（厥叶型或卷叶型）病毒，叶片畸形，初期有心叶叶脉皱缩，以后病叶增厚，叶缘向上卷曲；幼叶狭隘或涌现线状，后期植株上部显然呈丛簇状，节间短，植株矮小，结辣椒很少或不结辣椒，是常见的一种病毒。①坏死病，病株顶部叶片基部或沿主脉变褐坏死，有的幼花柄部变褐坏死，引起落叶、落花、落果，顶端呈光杆。②条斑病，主要发生在后期果实上，多是从果尖至上半部涌现褐色条斑，凹陷、果实变黄。
二、发病规律
辣椒病毒病的主要病源是烟草花叶病毒和黄瓜花叶病毒。花叶型、条斑型病毒是由烟草花叶病毒侵染引起的，它毒力强，可侵染多种植物，烟草花叶病毒在泥土中的病残体、种子或卷烟中过冬，主要经过田间农事操作，由叶片质液接触传播，特别碰到高温、干旱气象，有利于蚜虫滋生传播。畸形病是由黄瓜花叶病毒侵染引起的，它的寄生领域也很广，主要在多年生杂草及保护地蔬菜上越冬，翌年由蚜虫传播。总之，重茬，干旱缺水，泥土缺钙、缺钾、缺锌，管理粗放，苗小、定植晚等，均易引起该病风行。
三、防治方法
1。农业办法。
①选用抗病品种。依据各地栽培习惯选用抗病品种，通常叶细长、果实为牛角形或羊角形的辣椒比叶大而阔、果实为灯笼形的甜椒抗病毒病，耐热品种比耐寒品种抗病毒病。较抗病的甜椒品种有农大22号、农发甜椒、农乐甜椒、中椒5号、甜杂6号、充州1号等。及时消除病残体，增施磷、钾、锌、钙肥，叶面喷施微肥，加强抗病力。
②种子消毒解决。用10％磷酸三袖浓液浸种20—30分钟，洗净。或将充分单调的种子置于70℃的恒温箱内干热解决3天。
③苗床消毒。选择新茬地块，起出苗床土，每立方米土加50％多菌灵100克拌匀过筛后填于苗床内，再用50％多菌灵加50％乙磷铝锰锌，按每平方米各10克加细干土拌匀，撒入畦面划锄入土。
④适时浇水。高温时可5—10天浇一遍水，以增大温差减轻发病。⑤间作遮阳。采取先进技巧，推广运用遮阳网，避免高柔和烈日曝晒；或采取与玉米、虹豆、菜豆、瓜类等高秆作物间作，避免强光高温损害。
2。治虫防病。幼苗期，定植缓苗期及中后期及早治蚜虫防病。
3。药剂防治。目前防治病毒病尚无特效药物，应以“预防为主”，依据现有的药物配合使用，尽量抑制病毒病的发生。可用5％菌毒清300倍液，1.5％植病灵500倍，硫酸锌800倍（或高锰酸钾1000倍）再加入绿芬威1号1000倍；也可用5％菌毒清300倍，20％病毒A500倍，磷酸三钠500倍，再加黄腐盐；2.8％克病灵500倍，辣椒灵1000倍再加叶面肥等。