甜樱桃扦插不易生根，生产上都采用嫁接繁殖。由于地上部分的生长、结果以及本身的抗病性有很大影响，因此，选合适的砧木非常重要。国内外用作甜樱桃的砧木种类很多、日前我国应用的甜樱桃的砧木主要有中国樱桃、欧洲酸樱桃、考(Colt)和马哈利樱桃等。
1.中国樱桃通称小樱桃，是我国普遍采用的一种樱桃限木。北自辽南，南到云、贵、川各省，都有分布，而以山东、江苏安徽和浙江为多。中国樱桃为小乔木或灌木，分蘖力极强，能自花结实，适应性广，较耐干旱和瘠薄，但不抗涝，根系较浅，须根发达作为砧木，其所嫁接苗木根系的深浅、固地性的强弱，不同种类之间有所差别。种子数量多，出苗率高，同时扦插也较易生根，嫁接成活率高，进入结果期早。但由于根系浅，遇大风易倒伏。中国樱桃较抗根癌病，但病毒病较严重。目前生产上常用的有以下几种。
(1)大叶草樱桃这是烟台地区常用的一种樱桃嫁接砧木。当地用的草樱桃有2种，一种是大叶草樱，另一种是小叶草樱。大叶草樱叶片大而厚，根系分布较深，毛根较少，粗根多。嫁接甜樱桃后固地性好，长势强，不易倒伏，抗逆性较强，寿命长，是甜樱桃的优良砧木。而小叶草樱叶片小而薄，分枝多，根系浅，毛根多，粗根少。嫁接甜樱桃后，固地性差，长势弱，易倒伏，而且抗逆性差，寿命短，故不宜采用。
(2)莱阳矮樱桃为20世纪80年代山东省莱阳市林业局对当地中国樱桃资源考察时发现的，主要特点是树体矮小紧凑，仅为普通型樱桃树冠大小的2/3。树势强健，树姿直立，分枝较多，节间短，叶片大而厚。果实产量高，品质好，当地也用作生产品种。由于其具有矮化特性，因而很适宜在塑料大棚中栽培。用莱阳矮樱桃嫁接甜樱桃，亲和力强，成活率高。1年生的嫁接苗生长量比较小，有明显的矮化性能，生产上适合于大棚栽培。但目前已发现有的嫁接树树龄不大，就有病毒病症状。所以能否广泛利用，尚需进一步观察。
(3)北京对樱桃是北京地区生产上发展较多的一个中国樱桃品种，有一定产量，繁殖容易，嫁接甜樱桃成活率高。近几年有些地区利用它作砧木嫁接甜樱桃，但根系浅，抗寒、抗风力差。(4)山樱桃又名青肤樱、山豆子。果实极小，没有经济价值故不作为生产利用的品种。在辽宁本溪、河北北部及山东昆嵛山区，有野生分布的山樱桃。它是辽宁省旅大地区主要利用的樱桃树砧木。山樱桃主要用种子繁殖。硬枝扦插不易生根，嫩枝扦插容易生根。用实生砧嫁接甜樱桃，表现亲和力强，根系发达，抗寒性强，嫁接苗生长势旺，但易感染根癌病。
2.毛把酸这是欧洲酸樱桃的一个品种，1871年由美国引入我国烟台，在山东省福山、邹县发展，新疆南部也有栽培。为灌木或小乔木，树冠矮小，树势强，叶片小。果实红紫色，平均单果重2.9克。扁圆形，果顶平，微下凹。果梗粗短，易与果实脱离。果实皮厚，易剥离。肉质柔软，味酸，有一定的经济价值毛把酸种子发芽率高，根系发达，固地性强。实生苗主根粗细根多，须根少而短。与甜樱桃亲和力强。嫁接树生长健旺，树冠高大，属乔化砧木。丰产，长寿。不易倒伏，耐寒力强。但在黏性土壤上生长不良，并且容易感染根癌病。
3.考脱由英国东茂林试验站1958年用欧洲甜樱桃和中国樱桃杂交发育而成，于1977年推出。通过鉴定为无病毒的无性系砧木。嫁接甜樱桃定植后4~5年，树冠大小和普通砧木无明显差别，以后随着树龄的增长表现出矮化效应，其生长量与马扎德实生砧木相比，要矮化20%~30%。目前，它是欧美各国甜樱桃的主我国于1984年从意大利引进考脱砧木，在笔者实验室里用组织培养进行快速繁殖。1986年在山东省临朐县中国北方果树木繁殖场，用组织培养及嫩枝雾插法大量繁殖苗木，并嫁接甜的优良品种。
1990年前后，分别在临朐县城郊、北京市十三场、北京市顺义县高丽营镇和马坡乡，以及全国各地栽培了数百公顷。从后来的结果看，甜樱桃生长结果表现良好，根系十分发达特别是侧根及须根生长量大，固地性强，较抗旱和耐涝;嫁接亲和力好，成活率高。一般品种接后3年即可开花结果，5年后进入盛果期，6年生树最高株产量达27.5千克，7年生树达43千克。在十三陵农场进行比较，用中国樱桃嫁接的甜樱桃树，生长、结果不整齐，每年都有一部分树叶萌发晚并逐渐死亡;而用考脱砧木嫁接的甜樱桃树，生长和结果都非常整齐，没有死树。同时，用考脱砧木嫁接的甜樱桃成熟期早，个头大，品质好。如在北京的考脱砧红灯品种，果实成熟期在5月23日左右，单果重多数在10克以上而且味浓，甜酸适口。考脱砧木的缺点是不抗根癌病。在山东省烟台有些地区根癌病比较严重，这和育苗时苗木带病以及土壤中有菌等因素有关。在山东省临朐县中国北方果树苗木繁育场早期生产的樱桃苗，从近20年的表现看，基本上没有这类问题。
4.马哈利樱桃这是国外几十年前所多采用的甜樱桃的砧木，在我国大连地区也有应用。根系发达，耐旱，适应性强，种子出苗率高，生长健壮，有矮化作用，结果较早。但在黏土地上表现不良，嫁接亲和力较差，20年后常表现早衰。另外，有些地方曾试用欧李及毛樱桃作砧木嫁接甜樱桃，结果表明，用欧李嫁接甜樱桃能成活，表现极矮化，但寿命短。用毛樱桃作砧木嫁接甜樱桃，成活率低，接活后2~3年即逐渐死亡。因此生产上不能采用。除以上砧木外，国外还培育了一些新樱桃砧木。例如，渥本赫姆由德国渥本赫姆试验站选育而成，与樱桃嫁接亲和力强，固地性好，抗颈腐病。GM系由比利时琼布罗果树蔬菜研究站选育而成的GM,嫁接樱桃后能增大果个和增进果色。樱桃砧木1号由前苏联奥尔洛夫果树试验站选育而成，能抗一30℃~一40℃的低温。美国的M×M系列，为俄勒冈州选育的半矮化砧和矮化砧，嫁接樱桃后能早期丰产。法国培育的SL64也是矮化砧，表现极丰产。另外，辽宁省大连农科所培育的11-93为半矮化砧，对病毒和根癌病有较好的抗性。