柴油机使用一段时间后，由于各种因素的影响，会使零部件的工作能力逐渐降低、整机技术状态逐渐变坏，影响柴油机的正常使用，为此需要定期检查保养。保养采用清洗、紧固、调整、更换、添加等维护性技术措施，以保持零部件的正常工作能力和柴油机的正常工作状态。此外，柴油机的净化工作也很重要。
一是燃油净。柴油净化有三种方法。首先是把购回来的柴油静置沉淀96小时以上，再就是加油时将漏斗加滤网，再加一层绸布。从油桶取油时，取过滤器外加包一层绸布，并应定期清洗或更换。
二是空气净。发动机运转时，气缸每分钟吸入空气2～4立方米。为了保证进入气缸的空气干净，必须对空气滤清器加强检查，定期清洗。
三是润滑油净。要经常注意使用洁净的符合本机标准的润滑油。机油过滤器的过滤芯要定期清洗，转子式的过滤器在转子内壁贴一层宽窄长短合适的牛皮纸，便于在离心作用下吸附污垢。滤芯上吸附的污物清洗时最好用打气筒充气，从内向外吹气，用毛刷刷洗，绝不要用手抹。黄油要用洁净的钙基润滑脂，勿随便乱注其他润滑油。
四是冷却水净。发动机冷却水最好用软水，即雨水或经处理的自来水和洁净的井水等，冷却系统清洗时按水容积的比例加1％的烧碱和0．5％的煤油。
五是机具净。农机具作业大多在野外、露天，经常和灰尘、泥沙、水接触，柴油机机体最易脏污。因此，要经常擦洗，使机身不生锈，必要时给予补漆，以防锈蚀。