秋收作业结束后，机手应及时做好水稻联合收割机的维护保养和存放保管工作，使之技术状态良好，这对延长收割机的使用寿命和下一年的使用很重要。联合收割机维护保管要做好以下几点：
一是选择好存放地点。联合收割机结构复杂、薄板件多、体积大，应采用室内或棚遮的方式保管，存放地点应干燥、通风良好、排水畅通，存放场所应避开火源，并配有防火器材。库房内不要存放酸、碱、盐、农药、化肥、电池等有腐蚀性的物质。
二是清洗各零部件。对收割机外部进行清洗，注意清理滚筒凹板部件、籽粒推运器、谷粒抖筛动子部件、机动逐稿和割台倾斜喂入室等机器内部物体的附着物，然后拆下皮带、电器等，用压力水对整机进行冲洗。
三是进行润滑保护。对联合收割机的各密封轴承、含油轴承及所有带油嘴的轴承统一注入新鲜的黄油，对拨禾轮、搅拢伸缩杆套、张紧螺杆等可调节螺栓、螺纹及动力定刀片等部位也应进行润滑，轴承损坏的应及时更换并及时加注润滑黄油。
四是蓄电池的存放。蓄电池冬春存放保管有两种方式：一是原件存放，即拆下蓄电池放置到干燥的室内，并定期检查电解液中的水分蒸发情况，电解液面不得低于极板高度，必要时可添加蒸馏水，保持蓄电池处于待贮状态；二是卸下蓄电池单独存放，将蓄电池完全放电，倒出电解液后用蒸馏水反复冲洗，直到水无酸性为止，倒出水后晾干拧紧孔盖，密封通气孔，可长期存放。
五是防止传动带传动链老化。卸下全部的三角传动带，擦干净后，涂上滑石粉，用塑料袋装好，挂在库内的墙壁上；卸下传动链条放入柴油中清洗干净，涂上机油或黄油，用塑料纸包好，存放在醒目的通风干燥处。
六是发动机的保养。将发动机水箱、机体放水开关打开放净水；放出油箱中的燃油；用塑料布将空气滤清器，排气管口，燃油箱加油口等部位包好，避免空气中的水分和灰尘进入发动机内。向气缸内注入适量的清洁机油，并转动曲轴数圈。