收割机在操作不当时会出现跑粮现象，但通过适当调整可以有效控制这一问题。
调整清选部位至关重要。对于成熟度低和潮湿的作物，应尽量增大上筛片的开度，以避免杂质堵塞推进器；而对于成熟度高、干燥的作物，上筛片只需打开2/3。下筛片的开度应小于上筛片，上筛全开时，下筛可开2/3，上筛开度减少，下筛也相应减少。风量的调整应以粒中无谷壳、谷壳中无谷粒为准。如果谷粒中谷壳多，应增大风量；如果筛后吹出的谷粒和断穗多，应减少风量。
控制拔禾轮的旋转速度也是关键。转速过高会加大穗头的打击力，导致落粒损失；转速过低则会导致秸秆不能及时被拔向切割器，增加切割难度和秸秆振动，同样会增加掉粒损失。拔禾轮的转速应与收割机的前进速度相匹配。此外，拔禾轮的位置过高会打击穗头，引起落粒损失；位置过低则会导致割下的禾秆被甩出机外，也造成落粒损失。作业时，应根据秸秆高矮调整拔禾轮高度，使其拔板作用点在切割线上方2/3处，对于矮秆或倒伏庄稼，拔禾轮高度应相应降低。
掌握正确的前进速度和喂入量是提高效率的关键。喂入量超过额定量时，联合收割机会处于超负荷作业状态。驾驶员应根据秸秆高低、产量等因素调整前进速度，控制喂入量，确保收割机的前进速度、喂入量、脱粒、分离、清选等环节协调一致，避免超负荷作业。
合理调整脱粒间隙同样重要。如果凹板入口、出口间隙小而滚筒转速高，秸秆难以进入下一道工序，脱掉的谷粒也无法及时排出，增加破碎率。脱粒的最小间隙不应小于4毫米，同时需检查滚筒皮带轮与动力皮带轮的搭配是否合理、准确。
