1.种鹅营养不良
种鹅营养不良可能会造成胚胎发育不良、死胚以及雏鹅畸形等，严重降低孵化率。
预防措施：必须加强种鹅的营养，特别是在种鹅进入产蛋期后1个月内要增加豆饼、花生饼的用量，使饲料蛋白质水平达到17%左右。同时，还要添加多种维生素和微量元素添加剂，平衡饲料营养，使其达到产蛋期的营养要求。
2.受精率过低
鹅蛋受精率一般为75%～85%，如果无精蛋超过30%，即为异常情况。受精率过低主要原因有公、母鹅比例不协调，种鹅年老、过于肥胖或跛脚，缺乏交配的水池以及繁殖季节青绿饲料供应不足等。种蛋受精率低，孵化率就更低。
预防措施：为了提高鹅种蛋的受精率，必须严格选留种鹅，剔除和淘汰少数发育不良、体质瘦弱和配种能力不强的个体。一般小型品种鹅的公、母比例为1∶，中型品种鹅为1∶，大型品种鹅为1∶，并提供适宜水面供鹅交配。产蛋前应给种鹅补饲大麦芽等，以补充维生素的不足，确保营养需要。值得注意的是，初产蛋受精率都很低，一般不做种蛋。
3.种蛋太脏
鹅种蛋外面黏有一些粪便、泥土、草末等时，易被细菌侵入，引起腐败，同时还会堵塞气孔，影响气体交换而形成死胎，降低孵化率。
预防措施：除让种鹅定点产蛋、经常更换垫草以保证种蛋清洁外，种蛋入孵前必须进行消毒，常用的消毒方法是熏蒸消毒法，用量为每立方米空间用甲醛14毫升、高锰酸钾7克，熏蒸0.5小时，然后用排气扇排出气体。
4.种蛋储存时间过长
种蛋储存时间过长，水分蒸发过多，会导致蛋内pH值的改变，各种酶的活动加强，引起胚胎的老化、营养物质的变化与残余细菌的繁殖，从而危害胚胎，降低孵化率。
预防措施：种蛋储存时间以7天以内为宜，夏天以保存3天为宜。天气凉爽如早春、初秋时，种蛋储存时间可相对长些；严冬和酷暑时，种蛋储存时间要相对短些。此外，种蛋储存时间超过7天后，每天要翻蛋1～2次。
5.孵化温、湿度不适宜
胚胎发育的临界温度为23.9℃，超过这一温度胚胎开始缓慢发育，尽管发育程度有限，但细胞的代谢会逐渐导致鹅胚衰老和死亡。为了抑制酶的活动和细菌繁殖，种蛋应在低于胚胎发育的临界温度以下保存，但温度低于0℃后，种蛋易受冻，受冻的种蛋将失去孵化能力。
储存室相对湿度过高，容易引起蛋壳表面细菌和病原体的繁殖，还易引起种蛋发霉；湿度过低，在保存过程中，蛋内水分蒸发，气室增大，引起种蛋失水过多，也会影响孵化效果。
预防措施：种蛋储存时间不同温度也稍有差异，7天以内的控制在15℃较为适宜，7天以上以11℃为宜。储存前，如果种蛋的温度较高，应逐渐降温，使蛋温接近储存室温度后再放入。储存室内相对湿度一般以控制在70%～80%为佳。