国家相关法律法规是农机管理部门依法行政的重要依据。例如《农业机械管理条例》规定了农机管理的基本制度，明确了农机管理部门的职责和权限，对农机的登记、备案、检验等环节进行了详细规定。此外，还有《农机购置补贴管理办法》、《农机安全操作管理办法》等法规，进一步加强了对农机管理的监管。
规章制度也是农机管理部门依法行政的重要依据。这些规章制度是在法律法规的基础上制定的具体管理措施。例如，农机管理部门会制定《农机购置补贴实施细则》、《农机检验标准》等规章制度，明确了农机购置补贴的申请流程、农机检验的标准要求等，为农机管理部门提供了具体操作指南。
此外，政府文件也是农机管理部门依法行政的重要依据之一。政府文件通常是由上级行政机关发布的具有行政效力的文件。例如，农机管理部门可能会根据国家农机管理政策制定实施细则，或者发布通知、通告等文件，对农机管理的具体要求进行解释和补充。