在开始使用拖拉机之前，应该对动力输出轴进行检查。检查是否有损坏、磨损、缺油等情况。如果有，应及时进行修理和更换。另外，还需检查轴承和密封件的情况，确保其良好的工作状态。
在磨合过程中，应遵循以下几个原则。首先，磨合过程应该持续一段时间，一般建议在30至50个工作小时内完成。其次，初始磨合时，应该避免大负载和高速工作，以免对动力输出轴产生过大的压力。此外，要保持合理的转速，不可频繁变速。最后，要定期检查轴承和密封件的磨损情况，及时进行维护和更换。
在磨合过程中，需要注意的是，避免长时间低速行驶和高速行驶。长时间低速行驶容易造成润滑不良，导致轴承过热。高速行驶则容易产生过大的摩擦热量，加剧磨损。此外，还要避免拖拉机频繁启动和停止，以免产生冲击力，对动力输出轴造成损伤。
此外，还可以采取一些额外的措施，来保护动力输出轴的正常工作。例如，正确使用润滑油，定期更换。另外，要确保驾驶员正确操作拖拉机，避免熄火、急刹车等不正常操作，以减少对动力输出轴的冲击。