四轮驱动拖拉机相对于传统的两轮驱动拖拉机而言，其结构更为复杂。它需要额外的传动装置和差速器来实现四个车轮的独立驱动，这增加了设计和制造的难度，也增加了故障的可能性。同时，复杂的结构也增加了维修和保养的难度，对操作员的技术要求更高。
四轮驱动拖拉机的重量相对较大。为了实现良好的牵引力和操纵性能，这种拖拉机通常需要配备较大的发动机和传动系统，导致整体重量较大。这不仅增加了对地面的压力，容易导致地面损坏，还限制了其在柔软地面上的应用能力。此外，重量的增加也会对燃油经济性产生不利影响，增加了使用成本。
四轮驱动拖拉机的转弯半径相对较大。由于四个车轮都能独立驱动，车辆在转弯时需要通过差速器来实现内外轮的不同转速，从而完成转弯操作。这种结构限制了拖拉机的转弯灵活性，使得它在狭窄的场地和狭窄的道路上操作困难。对于农田和工地等限制条件较多的环境，这种缺点可能会影响工作效率。