联合收割机的机械部分是最容易发生故障的。它们经常在野外工作，需要经常清洗和保养。机器要长时间运转，自然会磨损，因此，联合收割机的部件磨损也是一个常见故障原因。比如，轴承损坏，链条断裂等。
联合收割机的电气部分也会出现故障，这是因为联合收割机的电子部分是复杂的，包括发动机、传感器、控制系统等等。发动机部分是最容易出现问题的，因为它需要长时间保持高效节能的运转状态。传感器负责测量温度，速度，压力等参数，它们的损坏会导致机器不能正常运转。控制系统用于控制机器的运转状态，如果出现故障，就会影响机器的整体性能。
再者，联合收割机使用环境也是导致它经常发生故障的一个原因。农田的环境非常复杂，有时耕地的起伏地形会影响机器的运转，有时收割的作物的品种和密度也会对机器造成不同的影响。另外，天气也是一个重要的因素，如果遇到降雨天气，机器可能会遇到堵塞，导致严重的故障。