国二排量和国三排量拖拉机在发动机技术上有所不同。国二排量拖拉机采用的是老式的机械燃油喷射技术，燃油燃烧效率相对较低，排放控制能力有限。而国三排量拖拉机则引入了电子控制喷射技术，通过精确控制燃油的喷射量和喷射时机，提高了燃烧效率，减少了尾气排放。
国二排量和国三排量拖拉机在尾气排放上也有明显区别。国二排量拖拉机的尾气中含有大量的一氧化碳、氮氧化物和颗粒物等有害物质，对环境和人体健康都有一定的影响。而国三排量拖拉机在尾气排放方面有了明显改善，其尾气中的有害物质排放大大降低，对环境污染减少，对人体健康更加友好。
此外，国二排量和国三排量拖拉机在燃油经济性上也有区别。国三排量拖拉机采用了更高效的燃烧技术和先进的燃油供给系统，使得燃油的利用率更高，能耗更低。相对而言，国二排量拖拉机的能耗较高，使用成本也相应增加。