首先是独立式机耕船。这种类型的机耕船通常具备独立的动力系统和作业装置，可以独立完成耕作作业。它们不依赖于其他机械设备，具有较高的作业自主性和灵活性。独立式机耕船通常具备较大的动力和作业能力，适用于大面积水稻田等作业场地。
其次是配套式机耕船。这种类型的机耕船通常与拖拉机配套使用，依靠拖拉机提供动力，并通过连接装置与拖拉机进行机械传动。配套式机耕船具有拖拉机的优势，如便于操控、调整和维护。同时，由于与拖拉机的配套使用，配套式机耕船可以根据实际需要进行灵活组合，适应不同的作业场地和作业要求。
另外，还有一种混合式机耕船。这种类型的机耕船通过多种农业机械和设备的组合使用，实现不同作业环节的高效配合。例如，机耕船可以配备播种机、化肥施肥器、除草机等作业装置，实现全程机械化作业。混合式机耕船具有较高的作业效率和灵活性，能够适应不同的作业要求和农田条件。