拖拉机配气机构容易出现进气门或排气门卡死的情况。这可能是由于进气门或排气门的清洁度不够，积碳过多导致的。解决办法是定期清洗进气门和排气门，并加强发动机的保养，定期更换机油和空气滤清器。
配气机构容易出现进气门或排气门松动的情况。这可能是由于螺栓松动或垫片老化导致的。解决办法是定期检查螺栓的紧固度，及时更换老化的垫片，并使用适当的扭矩进行固定。
另外，拖拉机配气机构还容易出现进气门或排气门的间隙过大或过小的情况。间隙过大会导致气缸压力下降，影响动力输出；而间隙过小则容易导致气缸发生撞击，进而损坏发动机。解决办法是定期检查和调整进气门和排气门的间隙，确保其在规定范围内。
拖拉机配气机构还容易出现凸轮轴、凸轮轴轴承和凸轮轴传动齿轮的损坏情况。这可能是由于长时间使用导致磨损，或者不合适的润滑油造成的。解决办法是定期更换润滑油，并保持凸轮轴和轴承的适当润滑。