从法律上讲，根据《机动车登记规定》，行车证是机动车辆的身份证明，号牌是机动车辆的标识，两者是不同的东西。在规定中，并没有明确规定行车证编号必须与拖拉机号牌编号相同。因此，从法律层面上来说，行车证编号和拖拉机的号牌编号可以不一致。
从具体情况来看，有些拖拉机的行车证编号和号牌编号确实是不一致的。这是因为拖拉机的号牌是根据其车架号或发动机号来领取的，而行车证编号则是根据车主或管理人的身份、地址、车型等信息生成的。在某些情况下，这些信息可能会发生变化，导致行车证编号和拖拉机号牌编号不一致。
但是，需要注意的是，虽然法律上并没有要求行车证编号必须与拖拉机号牌编号相同，但是如果行车证和号牌不一致，可能会对车辆的使用和管理产生一定的影响。例如，如果拖拉机的行车证与号牌不一致，可能会导致交通管理部门在查验时存在疑虑，车主需要花费更多的时间和精力来解决问题。