变型拖拉机的运输速度相对较慢，通常在40-60公里/小时。这意味着在高速公路等快速路段上行驶，可能会与其他车辆形成速度差，增加了事故的风险。此外，由于变型拖拉机的车身较长，容易造成车辆超限超载，给道路交通安全带来威胁。因此，使用变型拖拉机进行运输时，应尽量选择较为安全的道路，并确保符合交通法规的要求。
变型拖拉机的操控相对较为复杂，需要一定的驾驶技能和经验。由于其外形与传统拖拉机有所不同，驾驶员可能需要一定时间适应。同时，变型拖拉机的转弯半径较大，操控性较差，容易发生侧翻等意外情况。因此，在使用变型拖拉机进行运输时，驾驶员应接受专业培训，了解其操作要领，并保持谨慎驾驶的态度。
另外，变型拖拉机在运输过程中还存在着货物安全的风险。由于其车厢较为开放，无法完全封闭，所以货物易受风吹雨淋，容易受到外界环境的影响。特别是运输易碎或易腐烂的货物时，更需要特别注意保护措施的落实。同时，在运输过程中应合理安排货物的堆放，确保稳定性，避免货物滑落或倾覆导致的安全事故。