第一种情况是拖拉机超过了使用期限。按照国家规定，拖拉机使用年限为15年，超过这个期限的拖拉机将不再适用于道路交通运输。因此，这类拖拉机即使通过年检，也不会被发放合格标志。
第二种情况是拖拉机存在安全隐患。在年检过程中，如果工作人员发现拖拉机存在安全隐患，如制动不良、照明设备不齐全、车架变形等情况，将禁止其上路行驶。只有在解决了这些问题并重新通过年检后，才能获得合格标志。
第三种情况是拖拉机不符合相关规定。在年检时，如果拖拉机的尺寸、重量、轴距等参数不符合规定，或者未按照规定进行改装或加装设备，也将不会被发放合格标志。因此，拖拉机所有者在年检前需要仔细检查拖拉机是否符合相关规定，以避免拖拉机被禁止上路行驶。