我们需要了解主离合器的作用。主离合器是用来连接和分离发动机和传动系统的重要元件。当主离合器处于连接状态时，它将发动机的动力传递给传动系统，使拖拉机的动力输出轴转动。而当主离合器处于分离状态时，它会切断动力传递，使动力输出轴停止转动。
那么，当拖拉机分离主离合器时动力输出轴停止转动的原因是什么呢？
可能是由于主离合器本身的故障导致的。主离合器是一个复杂的机械装置，如果其中的零部件出现磨损、断裂或失灵等情况，就会导致主离合器无法正常连接或分离，进而导致动力输出轴停止转动。
还有可能是由于传动系统的问题导致的。传动系统由离合器、齿轮和传动轴等部件组成，如果其中的任何一个部件出现故障，就会导致动力无法传递给动力输出轴，从而使其停止转动。
此外，还有可能是由于液压系统的故障导致的。一些拖拉机采用液压离合器，当液压系统发生故障时，就会导致离合器无法正常工作，进而导致动力输出轴停止转动。