一种常见的连接方式是通过联轴器连接发动机和传动箱。联轴器是一种能够传递扭矩和旋转速度的装置，可以将两个不同的轴连接在一起。在微耕机中，联轴器通常安装在发动机和传动箱的输入轴上，通过将发动机和传动箱的输入轴连接起来，实现动力的传递。
另一种常见的连接方式是通过皮带传动连接发动机和传动箱。这种方式利用了皮带的柔性和传动效率高的特点。发动机上安装有一个带有凸起的轮盘，传动箱上则有一个与之匹配的凹槽。通过将皮带套在这两个轮盘上，发动机的动力可以通过皮带传递给传动箱，实现耕耘刀具的运转。
除了以上两种常见的连接方式，还有一些微耕机采用链传动的连接方式。链传动借助链条的柔性和可靠性，将发动机和传动箱的轴连接起来，实现动力的传递。链传动通常需要定期润滑和维护，以确保其正常运行。