农机大户面临着农业生产的不确定因素。农业生产受天气、气候、病虫害等自然因素的影响较大。农机大户在投入大量资金购买农机设备后，如果遇到干旱、洪涝等灾害，会导致农业生产受损，造成经济损失。此外，农机大户还需要关注市场需求的变化，合理选择作物品种和种植面积，以确保产出与市场需求的匹配。
农机大户经营还面临着经营管理的困难。农机大户需要管理大量的农机设备和员工，需要进行设备维护、修理和管理人员培训等工作。此外，农机大户还需要进行农机设备的更新升级，以适应农业生产的新需求和新技术的应用。这些管理工作需要投入大量的人力、物力和财力，给农机大户的经营带来了一定的困难。
农机大户面临着融资困难。农机设备的购买和维护需要大量的资金投入，而传统的融资方式对农机大户来说并不容易获得。由于农业生产的特殊性，农机大户的资产和收入往往无法满足传统金融机构的贷款要求。因此，农机大户需要积极探索新的融资渠道，如农机大户联合社、农机专业合作社等，以确保经营的顺利进行。
农机大户还面临着政策支持不足的问题。虽然国家对农业发展给予了重视和支持，但在农机大户经营方面，政策支持还不够完善。农机设备的购置补贴、农机大户培训和技术支持等方面的政策还需要进一步完善和落实，以帮助农机大户解决经营中的困难和问题。